Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT09

CNPY3, Protein canopy homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY3Q9BT09 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CNPY3Q9BT09 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CNPY3Q9BT09 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms