Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
RTKNQ9BST9 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
RTKNQ9BST9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms