Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSA9

TMEM175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM175Q9BSA9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TMEM175Q9BSA9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms