Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP8

PYM1, Partner of Y14 and mago, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PYM1Q9BRP8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PYM1Q9BRP8 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PYM1Q9BRP8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms