Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SPOCK3Q9BQ16 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SPOCK3Q9BQ16 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms