Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PITX2Q99697 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PITX2Q99697 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms