Protein–RNA interactions for Protein: Q99612

KLF6, Krueppel-like factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF6Q99612 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
KLF6Q99612 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
KLF6Q99612 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KLF6Q99612 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms