Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TSPAN18Q96SJ8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms