Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CITED4Q96RK1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CITED4Q96RK1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms