Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PLIN4Q96Q06 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PLIN4Q96Q06 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.3 ms