Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CCDC115Q96NT0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.2 ms