Protein–RNA interactions for Protein: Q96NS8

CLUHP3, Putative protein CLUHP3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLUHP3Q96NS8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CLUHP3Q96NS8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
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