Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL6

SCLT1, Sodium channel and clathrin linker 1, humanhuman

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCLT1Q96NL6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SCLT1Q96NL6 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
SCLT1Q96NL6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms