Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD4

TRIM47, Tripartite motif-containing protein 47, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM47Q96LD4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM47Q96LD4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM47Q96LD4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms