Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
GJD4Q96KN9 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GJD4Q96KN9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms