Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ZBED3Q96IU2 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ZBED3Q96IU2 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
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