Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ZNF496Q96IT1 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ZNF496Q96IT1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms