Protein–RNA interactions for Protein: Q96IS3

RAX2, Retina and anterior neural fold homeobox protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAX2Q96IS3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAX2Q96IS3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
RAX2Q96IS3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms