Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC34Q96HJ3 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms