Protein–RNA interactions for Protein: Q96GC5

MRPL48, 39S ribosomal protein L48, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL48Q96GC5 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MRPL48Q96GC5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.6 ms