Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
BICD1Q96G01 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BICD1Q96G01 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BICD1Q96G01 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BICD1Q96G01 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
BICD1Q96G01 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BICD1Q96G01 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms