Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCDC51Q96ER9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCDC51Q96ER9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms