Protein–RNA interactions for Protein: Q96EC8

YIPF6, Protein YIPF6, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF6Q96EC8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
YIPF6Q96EC8 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms