Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CMTM5Q96DZ9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CMTM5Q96DZ9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms