Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TMIGD2Q96BF3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
TMIGD2Q96BF3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms