Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFT1Q96AA3 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RFT1Q96AA3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms