Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CAVIN3Q969G5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CAVIN3Q969G5 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms