Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
GTF3C6Q969F1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GTF3C6Q969F1 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms