Protein–RNA interactions for Protein: Q93038

TNFRSF25, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 25, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF25Q93038 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TNFRSF25Q93038 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TNFRSF25Q93038 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms