Protein–RNA interactions for Protein: Q93009

USP7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, humanhuman

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Length 1,102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP7Q93009 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
USP7Q93009 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP7Q93009 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
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USP7Q93009 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP7Q93009 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP7Q93009 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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USP7Q93009 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP7Q93009 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP7Q93009 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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