Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TNPO1Q92973 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TNPO1Q92973 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms