Protein–RNA interactions for Protein: Q92889

ERCC4, DNA repair endonuclease XPF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC4Q92889 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ERCC4Q92889 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ERCC4Q92889 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms