Protein–RNA interactions for Protein: Q92572

AP3S1, AP-3 complex subunit sigma-1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S1Q92572 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
AP3S1Q92572 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
AP3S1Q92572 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms