Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDN7

ACER1, Alkaline ceramidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACER1Q8TDN7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ACER1Q8TDN7 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ACER1Q8TDN7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms