Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD1

DDX54, ATP-dependent RNA helicase DDX54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX54Q8TDD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
DDX54Q8TDD1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
DDX54Q8TDD1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms