Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHZ7

MBD3L2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3L2Q8NHZ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MBD3L2Q8NHZ7 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MBD3L2Q8NHZ7 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 332.9 ms