Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PIK3C3Q8NEB9 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms