Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNNM3Q8NE01 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CNNM3Q8NE01 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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