Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDY6

BHLHE23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE23Q8NDY6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
BHLHE23Q8NDY6 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
BHLHE23Q8NDY6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms