Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TMEM35BQ8NCS4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TMEM35BQ8NCS4 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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