Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
ZIC4Q8N9L1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms