Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4E4

PDCL2, Phosducin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL2Q8N4E4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDCL2Q8N4E4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDCL2Q8N4E4 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms