Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0Y2

ZNF444, Zinc finger protein 444, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF444Q8N0Y2 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF444Q8N0Y2 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF444Q8N0Y2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms