Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZ73

RPUSD2, RNA pseudouridylate synthase domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPUSD2Q8IZ73 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RPUSD2Q8IZ73 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms