Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVW4

CDKL3, Cyclin-dependent kinase-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL3Q8IVW4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CDKL3Q8IVW4 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CDKL3Q8IVW4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms