Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SKAP1Q86WV1 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SKAP1Q86WV1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms