Protein–RNA interactions for Protein: Q86UA1

PRPF39, Pre-mRNA-processing factor 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39Q86UA1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRPF39Q86UA1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF39Q86UA1 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF39Q86UA1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PRPF39Q86UA1 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms