Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU1

TCF23, Transcription factor 23, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF23Q7RTU1 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
TCF23Q7RTU1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
TCF23Q7RTU1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms