Protein–RNA interactions for Protein: Q7LGA3

HS2ST1, Heparan sulfate 2-O-sulfotransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS2ST1Q7LGA3 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HS2ST1Q7LGA3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
HS2ST1Q7LGA3 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms