Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CAPN12Q6ZSI9 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CAPN12Q6ZSI9 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms